设有14个研究机构；有省部级以上工程中心（重点实验室、基地）26个，其中国家级有国家中医药现代化工程研究中心、国家新药（中药）安全评价研究重点实验室、国家新药（中药）临床试验研究中心、国家中药材种植栽培规范化研究示范基地、国家科技部国际合作示范基地等5个。先后有19项科技成果获得国家级奖励，其中国家发明奖3项（二、三、四等奖各1项）、国家科技进步奖8项（二、三等奖各4项）。2004年以来，承担各类科研课题1575项，其中国家级122项，省部级568项，厅局级885项，获得科研总经费近2亿元；取得各级奖励的科研成果144 项，其中国家级1项，省部级62项。2005年成为“973计划”项目首席科学家单位，获得首个广东省自然科学基金团队项目。

　　学校科研设施和经费改善了本科教学条件。2004到2007年共4年间，获得科研总经费近2.0亿元，其中一部分用于购置仪器设备及配套设施，改善科研实验室条件。这些科研实验室全部向本科生开放，间接地改善了本科教学条件，推进了科研成果进课堂、进教材。有计划地安排介绍学科科研最新成果的课程和讲座，开设博士生导师系列讲座、院长论坛等；鼓励教师把最新科研成果融进教材，丰富了教材内容，促进了教材建设；提倡教师在教学过程中引导学生了解学科前沿动态，并把新知识、新成果转化到教学内容中，丰富了课堂教学内容。教师的科研工作促进学生创新精神和动手能力的培养。